FAQ sobre openREDBAG

El proyecto tiene un ámbito Nacional y en él están implicados directamente los Jardines Botánicos de la Asociación Ibero-Macaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) a través de la Red Española de Bancos de Germoplasma (REDBAG). La dirección técnica del proyecto se llevará a cabo desde el Jardín Botánico Atlántico, en Gijón.

El proyecto se centra en cubrir las necesidades de Integración de datos sobre Recursos Fitogenéticos Silvestres (RRFFSS) para contribuir al desarrollo del Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres, según se desprende del IEPNB [Ley 42/2007, de 13 de diciembre, de Patrimonio Natural y Biodiversidad, Artículos 9.2.6; y 60.] y [Ley 42/2007, de 13 de diciembre, de Patrimonio Natural y Biodiversidad, Articulo 3.23 y 3.29] Se pretende crear una Plataforma Web de acceso a datos sobre RRFFSS que permita la explotación de los mismos mediante la implementación de servicios de descarga y visualización que den valor añadido para alcanzar los objetivos 1.1, 1.2, 1.3, 2.3 y 2.7 del Plan Estratégico del Patrimonio Natural y de la Biodiversidad 2011-2017. El uso común de la plataforma BABILONIA por los miembros de la REDBAG ofrece un punto de partida que ya incorpora estándares definidos en el ámbito de la gestión de datos de biodiversidad y que pretende ampliarse con otros (DarwinCore Germplasm extension) de uso más específico en materia de RRFFSS, al tiempo que se favorecen la sinergias entre proyectos orientados a facilitar y mejorar el conocimiento de la biodiversidad que es conservada en centros de investigación. Como resultado principal se proveerá un servicio de visualización y consulta de datos de interés para el desarrollo del IEPNB en materia de RRFFSS, que actualizará dinámicamente su información, a medida que se vaya completando la informatización de los registros custodiados en los distintos bancos de germoplasma. Al tiempo se establecerá y fortalecerá la ed Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos (REDBAG), mediante la incorporación de nuevos miembros y la utilización de la plataforma BABILONIA como herramienta de gestión de la información.

El proyecto pretende desarrollar una plataforma de datos abiertos para hacer accesible información sobre el material conservado en los bancos de germoplasma de la Asociación Iberomacaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) incluidos dentro de la REDBAG (Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos) y, en la medida de lo posible, de otras instituciones implicadas en la conservación de flora silvestre; para contribuir de este modo al desarrollo del Inventario Español de Patrimonio Natural y de la Biodiversidad (IEPNB). El principal objetivo consiste en la apertura de datos sobre RRFFSS, para que una vez publicados se pueda evaluar el grado de conocimiento que se tiene sobre los mismos (calidad), se mejore el acceso a los mismos, se puedan proveer servicios de valor añadido basados en el contexto del usuario (diferenciando el uso que se pueda hacer de los datos en función sus características: CCAA, MAGRAMA, Comunidad Científica, etc.) y se pueda dar respuesta parcial a los 3 tipos de contenido que precisa el IEPNB en este dominio: 1.- Listas de centros con RRFFS para el desarrollo del componente "Listado de centros oficiales" 2.- Catálogo e inventario del material genético y biológico existente para el desarrollo del componente "Catálogo e inventario del material genético y biológico existente en centros oficiales" 3.- Listado de taxones para el desarrollo del componente "Listado de taxones para los que existe material biológico y genético en los distintos Bancos oficiales, con referencia al tipo, cantidad y origen de las muestras almacenadas"

OE1. Contribuir a identificar, solucionar y mejorar los procesos de manejo de datos sobre RRFFSS para el desarrollo del Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres y el cumplimiento de los objetivos nacionales de acuerdo a la GSPC.

OE2. Disponibilizar de manera abierta los datos de las instituciones implicadas en la conservación de RRFFSS dentro de la REDBAG y, en la medida de lo posible, dentro de otras instituciones.

OE3. Desarrollo de un Portal Nacional de Acceso a RRFFSS gestionados por la REDBAG que ayude a resolver las necesidades que MAGRAMA, CCAA y otros organismos puedan tener en este dominio.

R1. Datasets con parte de los contenidos que establece el Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético referido a Especies Silvestres: Listado de Centros (todavía no oficiales), listado de taxones conservados (con información asociada) y Catálogo e inventario del material genético y biológico conservado.

R2. Adaptación de la plataforma BABILONIA para la mejor integración de los datos de las accesiones custodiadas en los Bancos de Germoplasma (BG) y su publicación de acuerdo a estándares.

R3. Conseguir que, al menos el 25% de las muestras de RRFFSS en BG de la Red Española de Recursos Fitogenéticos Silvestres (REDBAG) esté disponible a través de la plataforma BABILONIA y del Portal de RRFFSS.

R4. Directorio actualizado y sistema de registro nacional de organizaciones y personal vinculado a la gestión de RRFFSS en España (tanto de instituciones científicas, como de las diferentes administraciones con competencias).

R5. Portal Nacional de Acceso a Datos sobre Recursos Fitogenéticos Silvestres conservados en la REDBAG que permita, al menos, la publicación de datos incorporados a la plataforma BABILONIA y su utilización por parte de las CCAA, MAGRAMA y comunidad científica.

R6. Herramientas de visualización sobre los Indicadores del grado de cumplimiento de los compromisos adquiridos por el gobierno español y las CCAA, así como de la disponibilidad de RRFFSS.

Las actividades se organizan en los siguiente paquetes de trabajo PT0-PT4:

(PTO) Actividades de gestión del proyecto enfocadas a la dirección y objetivos del OPENREDBAG. Coordinación y administración de actividades y trabajos técnicos. Asegurar nivel de cooperación entre REDBAG, MAGRAMA y CCAA; comunicación y difusión de resultados. Control de calidad. Redacción de informes. Organización de reuniones. Asegurar visibilidad de resultados entre stakeholders. Facilitar la explotación de los resultados. Validación de datasets generales dentro del proyecto.

(PT1) Estudio del estado del arte, fijar los requisitos generales, situación actual y acometer las necesidades de mejora y adecuación de la plataforma BABILONIA a la gestión de los RRFFSS, incorporar herramientas que permitan gestionar desde BABILONIA la integración de los Jardines Botánicos al IPEN (sólo si dispone de reglamentación necesaria), para cumplir con ABS y desarrollo una arquitectura de alto nivel para todo el proyecto. Las actividades concretas en PT1 serán:

(T1-1) Definición de Estado del Arte y Análisis de requisitos de MAGRAMA y CCAA: mediante una reunión en Madrid con representantes del MAGRAMA donde se analizarán y documentarán las necesidades concretas de MAGRAMA de acuerdo a lo recogido en el Informe 2011 sobre el estado actual del IEPNB. Mediante el envío de encuestas a las diferentes CCAA se obtendrá información sobre las necesidades de gestión de las mismas en este dominio y sobre la existencia de Bancos de Germoplasma gestionados por la propia administración (a incluir en el listado de centros y personas). Esta actividad contribuye a la consecución de los resultados R1, R4 y R5

(T1-2) Desarrollo de la Arquitectura de alto nivel del proyecto OPENREDBAG: en base a la información obtenida por las diferentes administraciones se documentará la arquitectura de la plataforma de manera que en este documento de requisitos quede reflejado el contenido del portal de acceso a RRFFSS de la REDBAG. Esta actividad contribuye a la consecución de los resultados R5 y R6.

(T1-3) Especificación de vocabularios para el proyecto y adecuación de la plataforma BABILONIA, de manera que se definan los estándares básicos para homogeneizar la información utililzada por el Portal de Acceso a RRFFSS y se mejore la herramienta Babilonia para facilitar su explotación. Esta actividad contribuye directamente a la consecución del resultado R2 y en diferente medida a R1, R5 y R6.

(PT2) Adquisición, adecuación y volcado de datos de RRFFSS dentro de la plataforma BABILONIA de acuerdo a las metodologías consensuadas en la REDBAG y a las necesidades de gestión del IEPNB y CBD, con la participación de todos los Jardines Botánicos e instituciones interesadas que conservan RRFFSS. Depuración de datos propios dentro de cada institución con especial atención a la información sobre georeferenciación de accesiones. Las actividades concretas en PT2 serán:

(T2-1) Recopilación de conjuntos de datos disponibles en REDBAG y otras instituciones, adpatación de datos y mejora de los mismos: los diferentes JB's de la REDBAG adaptarán la información recogida en sus bases de datos para adaptarse correctamente al vocabulario y esquema definido en (T1-3).

(T2-2) Adaptación nomenclatural a los catálogos de protección de CCAA, nacional e internacional: se creará un grupo de expertos dentro de REDBAG encargado de revisar y la nomenclatura utilizada en los catálogos de protección (nacionales y regionales) para adaptarlos a las posibles sinonimias utilizadas en los diferentes conjuntos de datos incluidos en la aplicación, para alcanzar R1.

(T2-3) Volcado de conjuntos de datos, instituciones y personas implicadas en la gestión de RRFFSS a BABILONIA: los datasets de cada cada institución serán volcados a la aplicación Babilonia. Se establecerá un proceso de volcado y posterior revisión para mejorar la calidad de los datos. Esta actividad se encamina a la consecución de R3.

(PT3) Desarrollo del PORTAL NACIONAL DE ACCESO A DATOS ABIERTOS SOBRE RRFFSS que servirá como punto de referencia para la generación de informes y estadísticos a utilizar por el MAGRAMA en la elaboración del IEPNB y a las CCAA para conocer el estado de conservación de su flora amenazada o catalogada. Las actividades concretas en PT3 serán:

(T3-1) Implementación del Portal de acceso a RRFFSS: mediante subcontratación externa a una empresa de desarrollo web se creará el portal de acceso a RRFFSS de la REDBAG. La plataforma cumplirá con lo especificado en el documento de requisitos redactado a partir de los contenidos derivados de T1-1 y T1-2. La plataforma obtendrá datos directamente desde la base de datos de BABILONIA y se intentará desarrollar un módulo de importación de datos externos. En esta fase se desarrolla el prototipado 1.

(T3-2) Sistema de consulta y generador de informes con indicadores: la consulta a los datos se hará de manera gráfica mediante el uso de servicios de visualización de mapas y también mediante la visualización de gráficos estadísticos que den respuesta a los indicadores propuestos. En la medida de lo posible se desarrollará un sistema que permita exportar la información que se visualiza a un formato reutilizable. Los datos primarios de los diferentes bancos de germoplasma también podrán ser descargados para su reutilización por terceros. En esta fase se desarrolla el prototipado 2.

(T3-3) Revisión de implentación y desarrollo final del portal: de manera conjunta a las tareas finales de difusión y explotación de la herramienta (T4-2) se abrirá la plataforma en fase beta para poder ser analizada por los ususarios potenciales y administraciones. Con las aportaciones externas se desarrollará el producto final.

(PT4) Actividades destinadas a cubrir tareas horizontales como son la Difusión y explotación de la plataforma. Desarrollo de plan de comunicación del portal web, para obtener el mayor feedback posible por parte de los stakeholders, con especial atención a MAGRAMA y CCAA. Este paquete de trabajo se ha divido en dos fases: una fase inicial para el desarrollo de las herramientas básicas de comunicación y una segunda fase de difusión final de la aplicación que sirva para la obtención de feedback por parte de los usuarios finales. Las actividades de PT4 serán:

(T4-1) Plan de comunicación del proyecto: Creación y definición de stakeholders a los que dirigir la información inicial del desarrollo del proyecto. Crea una landing page del proyecto y puesta en marcha de los canales de comunicación a través de redes sociales. La REDBAG publicitará, a través de sus jardines botánicos, los avances del proyecto. (T4-2) Divulgación de la plataforma por parte de REDBAG: apertura de la web en fase beta y divulgación entre stakeholders para recibir propuestas de mejora y probar las herramientas generadas.

1. Listado de instituciones encargadas de la conservación de recursos fitogenéticos silvestres. Opcionalmente también se podrá integrar información de centros que conservan recursos fitogenéticos agrícolas (RFGAA), de acuerdo a los acrónimos institucionales utilizados por FAO, ya que se estima que aproximadamente el 10% de las accesiones conservadas en el Centro de Recursos Fitogenéticos (CRF-INIA) corresponden a especies silvestres emparentadas con plantas cultivadas.

2. Listado de personal de contacto y responsables de la gestión de los bancos de material biológico "Who is who?" en el ámbito de los RRFFSS en España.

3. Inventario con, al menos, el 25% del material de origen silvestre existente en los bancos de material genético que conservan RRFFSS incluidos en la REDBAG.

4. Inventario de RRFFSS procedentes de cada CCAA que permita identificar el material genético conservado en los bancos de material genético de la REDBAG.

5. Indicadores de la calidad, cantidad y de la información almacenada en la plataforma BABILONIA, referente a las muestras de material genético conservado. Estos indicadores podrán ser utilizados por las diferentes administraciones para evaluar el grado de cumplimiento de los objetivos propuestos, toda vez que los datos son actualizados dinámicamente según se van generando.

En la actualidad no se dispone de ningún sistema que permita evaluar dinámicamente la calidad y cantidad de los RRFFSS conservados en España. Según se desprende del Informe 2011 sobre el Estado del Patrimonio Natural y la Biodiversidad, en la REDBAG "existe información relevante para la elaboración de este Inventario", por lo que este proyecto pretende hacer accesible esta información para su incorporación en el Inventario. Las principales aportaciones en innovación que el presente proyecto aporta a la gestión de RRFFSS, se resumen en los siguientes puntos A1-A6:

A1. Desarrollo de un Portal de Acceso a RRFFSS que permita a cualquier usuario realizar consultas sobre el estado del arte en este dominio. En este portal se implementará, al menos, el diseño de los indicadores que precisa el desarrollo del Inventario Español de Patrimonio Natural y de la Biodiversidad (IEPNB) sobre Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres, dando prioridad a los informes que puedan ser requeridos por las CCAA para cumplir con parte de sus compromisos ante el MAGRAMA.

A2. En base al soporte que la aplicación BABILONIA proporciona a OPENREDBAG, la información es actualizada dinámicamente según se van incrementando los RRFFSS conservados en cada uno de los BG integrados en REDBAG.

A3. Si es posible, se proporcionan herramientas que permiten la incorporación de conjuntos de datos proporcionados por instituciones no integradas en REDBAG, para enriquecer la información disponible.

A4. Se impulsará, en la medida de lo posible, el enriquecimiento y la interoperabilidad de datos, para mejorar la gestión de conocimiento en el dominio de los RRFFSS, mediante la asignación de identificadores globales de recursos (URIs) para cada: - muestra referenciada en la plataforma BABILONIA - institución científica encargadas de la conservación de recursos fitogenéticos

A5. En la medida de lo posible, se intentará aplicar los principios de Open Data y Linked Data al campo de la gestión de RRFFSS, para la creación de una plataforma que favorezca el enriquecimiento y la interoperatibilidad de datos.

A6. Generación y publicación de datasets en diferentes formatos para permitir su integración y reutilización en plataformas semánticas, open data y otros portales de biodiversidad como BIODIVERSIA.

Otras organizaciones científicas como la Sociedad Española de Biología de Conservación de Plantas (SEBiCOP) ha mostrado su apoyo al proyecto. Otros centros no vinculados directamente a la REDBAG que puedan contribuir a completar el inventario de Recursos Fitogenéticos conservados en territorio Nacional también han mostrado su apoyo al proyecto y su disponibilidad para ofrecer sus datos a través de la plataforma BABILONIA, permitiendo de este modo su integración en la plataforma de acceso a recursos fitogenéticos silvestres propuesta en el proyecto. El MAGRAMA quen ha mostrado su disponibilidad para ofrecer la información derivada de la ejecución del proyecto AFA para poder vincular la información procedente de los Bancos de Germoplasma de la REDBAG con las poblaciones silvestres conocidas de taxones amenazados.